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DNA和RNA雙適配!華大智造SP-960助力天根生化高通量文庫建庫效率再升級

2025-07-23 16:48

高通量文庫製備過程中,自動化設備可有效簡化實驗流程、降低操作複雜度、縮短製備時間,並減少對操作人員專業技能的過度依賴。華大智造MGISP-960自動化樣本製備系統(以下簡稱「SP-960」)已完成天根生化科技(北京)有限公司(以下簡稱「天根生化」)TIANSeq通用型DNA文庫構建試劑盒和RNA文庫構建試劑盒的適配,大大豐富了建庫選擇,建庫效率再度升級!

隨着測序技術的深度發展與廣泛應用,高通量、高質量、高自動化已成為測序實驗的核心發展方向。文庫製備作為測序流程的關鍵環節,其效率與質量直接決定整體實驗結果。傳統手工製備模式存在明顯侷限性:操作繁瑣、耗時長、人為因素引發樣本誤差,且交叉污染風險較高,難以適配高通量測序的嚴格需求。因此,引入自動化設備成為突破上述瓶頸的關鍵手段。

華大智造SP-960自動化樣本製備系統性能卓越,集成PCR儀、温控模塊、振盪裝置等多種功能模塊,在保證高精度的同時確保優異的穩定性。該平臺支持軟硬件定製、開放腳本編輯及第三方試劑盒兼容,顯著提升交付效率與質量,使其成為高通量實驗室的理想選擇,為大規模科研提供有力支撐。基於SP-960,本文將呈現天根生化的兩款文庫製備產品——TIANSeq通用型DNA文庫構建試劑盒(Cat#NG111)與TIANSeq通用型RNA文庫構建試劑盒(Cat#NR122)的測評數據。

01TIANSeq通用型DNA文庫構建試劑盒PART.1測評方案

TIANSeq通用型DNA文庫構建試劑盒可在同一管內一步完成DNA片段化、末端修復及3'端dA尾添加,無需中間純化,大幅簡化實驗流程;且DNA樣本起始量低至1ng時仍能保持高文庫轉化效率。

在SP-960平臺上使用TIANSeq通用型DNA文庫構建試劑盒(Cat#NG111),搭配TIANSeq 雙索引接頭(MGI)(Cat#NG230),對NA12878和玉米基因組DNA進行自動化建和手工建庫。

PART.2測評結果

1)不同樣本類型,在相同起始量條件下,自動化文庫與手工文庫均有穩定產出

NA12878和玉米基因組DNA,起始量100ng,樣本NA12878的自動化成庫量CV值在5%以內,玉米基因組DNA的自動化成庫量CV值在6%左右,且自動化成庫量為手工成庫量的95%,自動化文庫與手工文庫均有穩定產出(表1,圖1)。

表1.NA12878和玉米基因組DNA文庫製備得率結果分析

圖1.基於SP-960的自動化建庫和手工建庫的文庫得率對比

2)對於相同樣本,自動化製備文庫與手工製備文庫的峰形分佈一致,且片段大小均符合預期範圍

圖2.Agilent2100 Bioanalyzer檢測結果

3)不同樣本類型的自動化文庫與手動文庫測序數據一致性高

比對率≥99%,關鍵指標如Effective Rate、Q20、Q30自動化與手工建庫的插入片段大小、GC含量等指標高度一致(表2)。

表2. NA12878和玉米測序數據質控分析

02TIANSeq通用型RNA文庫構建試劑盒PART.1測評方案

TIANSeq通用型RNA文庫構建試劑盒採用 「一鏈合成 + 雙鏈cDNA/末端修復/dA添加」 一步法,可實現快速一管式操作,無需純化直接連接接頭,大幅減少操作步驟;且兼容性強,適用於10ng-1μg總RNA 及低至100pg的mRNA 樣本,滿足多樣實驗需求。

RNA文庫製備試劑的測評樣本包括人、香菇和斑馬魚,經過TIANSeq mRNA捕獲磁珠(Cat#NR205)完成PolyA+RNA捕獲,其產物使用TIANSeq通用型RNA文庫構建試劑盒(Cat#NR122),搭配TIANSeq雙索引接頭(MGI)(Cat#NG230),分別進行后續自動化建庫和手工建庫。

PART.2測評結果

1)在SP-960上,自動化成庫量CV值均<10%,且自動化成庫量為手工成庫量的80%,自動化文庫與手工文庫均有穩定產出。(表3,圖3)

表3.人、香菇和斑馬魚RNA文庫製備得率結果分析

圖3. 基於SP-960的自動化建庫與手工建庫的文庫得率對比

2)通過對人、香菇和斑馬魚的轉錄組測序數據進行Gene body percentile 5'->3'分析,結果表明自動化文庫與手動文庫基因覆蓋度基本一致,自動化文庫製備在減少人力的同時,可保持手動建庫的數據質量。

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3)不同樣本類型的自動化文庫與手動文庫測序數據一致性高

通過對人總RNA的自動化文庫與手動文庫測序結果進行FPKM分析,結果表明自動化建庫與手動建庫有較強的一致性。

測評結論

基於SP-960高通量樣本製備系統與天根生化TIANSeq通用型DNA/RNA 文庫構建試劑盒(Cat#NG111/Cat#NR122)的適配應用,可在顯著節約時間與人力成本的同時,提供穩定可靠的建庫體驗。

華大智造MGISP系列自動化建庫設備具有可開放性與可拓展性,能夠適配多種第三方試劑,為大規模科研檢測提供高效穩定的自動化建庫解決方案。華大智造實驗室智能自動化業務(Generative Lab Intelligence,GLI)對公司原有的"實驗室自動化業務"進行了智能技術升級,以先進的"實驗室智能自動化"工具和平臺為GBI(Generative Bio Intelligence)提供基礎支撐,將生命科學實驗室所需的軟硬件系統、儀器設備和試劑耗材進行「標準化定義」,形成涵蓋AI 智能化工具模塊、通用自動化設備模塊、數據計算存儲模塊以及生態硬件模塊等功能模塊庫,並搭配設備耗材庫,提供AI助力的「Design-Build-Test-Learn」全流程閉環解決方案及豐富參考方案庫,已在多組學前沿、分子育種、抗體篩選、生物製藥等多領域賦能超50家行業用户,推動實驗室從「人工經驗」邁向「數據驅動」決策模式,提升整體運行效率與智能化水平。

天根生化適配MGISP-960高通量樣本製備系統的產品清單

關於天根生化

天根生化科技(北京)有限公司(簡稱「天根生化」)不斷致力於樣本前處理、核酸純化及下游檢測整體解決方案的優化與升級。憑藉豐富的專業經驗為分子診斷,生物醫藥,科技服務和畜牧養殖,食品生產加工等領域的企業客户提供從樣本處理到核酸提取、檢測的定製化解決方案。在高通量測序領域,天根生化也將持續加大研發投入,不斷推出更多符合市場需求的高品質產品,為生命科學研究和臨牀診斷檢測貢獻力量。

(華大智造)

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