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DNA和RNA双适配!华大智造SP-960助力天根生化高通量文库建库效率再升级

2025-07-23 16:48

高通量文库制备过程中,自动化设备可有效简化实验流程、降低操作复杂度、缩短制备时间,并减少对操作人员专业技能的过度依赖。华大智造MGISP-960自动化样本制备系统(以下简称“SP-960”)已完成天根生化科技(北京)有限公司(以下简称“天根生化”)TIANSeq通用型DNA文库构建试剂盒和RNA文库构建试剂盒的适配,大大丰富了建库选择,建库效率再度升级!

随着测序技术的深度发展与广泛应用,高通量、高质量、高自动化已成为测序实验的核心发展方向。文库制备作为测序流程的关键环节,其效率与质量直接决定整体实验结果。传统手工制备模式存在明显局限性:操作繁琐、耗时长、人为因素引发样本误差,且交叉污染风险较高,难以适配高通量测序的严格需求。因此,引入自动化设备成为突破上述瓶颈的关键手段。

华大智造SP-960自动化样本制备系统性能卓越,集成PCR仪、温控模块、振荡装置等多种功能模块,在保证高精度的同时确保优异的稳定性。该平台支持软硬件定制、开放脚本编辑及第三方试剂盒兼容,显著提升交付效率与质量,使其成为高通量实验室的理想选择,为大规模科研提供有力支撑。基于SP-960,本文将呈现天根生化的两款文库制备产品——TIANSeq通用型DNA文库构建试剂盒(Cat#NG111)与TIANSeq通用型RNA文库构建试剂盒(Cat#NR122)的测评数据。

01TIANSeq通用型DNA文库构建试剂盒PART.1测评方案

TIANSeq通用型DNA文库构建试剂盒可在同一管内一步完成DNA片段化、末端修复及3'端dA尾添加,无需中间纯化,大幅简化实验流程;且DNA样本起始量低至1ng时仍能保持高文库转化效率。

在SP-960平台上使用TIANSeq通用型DNA文库构建试剂盒(Cat#NG111),搭配TIANSeq 双索引接头(MGI)(Cat#NG230),对NA12878和玉米基因组DNA进行自动化建和手工建库。

PART.2测评结果

1)不同样本类型,在相同起始量条件下,自动化文库与手工文库均有稳定产出

NA12878和玉米基因组DNA,起始量100ng,样本NA12878的自动化成库量CV值在5%以内,玉米基因组DNA的自动化成库量CV值在6%左右,且自动化成库量为手工成库量的95%,自动化文库与手工文库均有稳定产出(表1,图1)。

表1.NA12878和玉米基因组DNA文库制备得率结果分析

图1.基于SP-960的自动化建库和手工建库的文库得率对比

2)对于相同样本,自动化制备文库与手工制备文库的峰形分布一致,且片段大小均符合预期范围

图2.Agilent2100 Bioanalyzer检测结果

3)不同样本类型的自动化文库与手动文库测序数据一致性高

比对率≥99%,关键指标如Effective Rate、Q20、Q30自动化与手工建库的插入片段大小、GC含量等指标高度一致(表2)。

表2. NA12878和玉米测序数据质控分析

02TIANSeq通用型RNA文库构建试剂盒PART.1测评方案

TIANSeq通用型RNA文库构建试剂盒采用 “一链合成 + 双链cDNA/末端修复/dA添加” 一步法,可实现快速一管式操作,无需纯化直接连接接头,大幅减少操作步骤;且兼容性强,适用于10ng-1μg总RNA 及低至100pg的mRNA 样本,满足多样实验需求。

RNA文库制备试剂的测评样本包括人、香菇和斑马鱼,经过TIANSeq mRNA捕获磁珠(Cat#NR205)完成PolyA+RNA捕获,其产物使用TIANSeq通用型RNA文库构建试剂盒(Cat#NR122),搭配TIANSeq双索引接头(MGI)(Cat#NG230),分别进行后续自动化建库和手工建库。

PART.2测评结果

1)在SP-960上,自动化成库量CV值均<10%,且自动化成库量为手工成库量的80%,自动化文库与手工文库均有稳定产出。(表3,图3)

表3.人、香菇和斑马鱼RNA文库制备得率结果分析

图3. 基于SP-960的自动化建库与手工建库的文库得率对比

2)通过对人、香菇和斑马鱼的转录组测序数据进行Gene body percentile 5'->3'分析,结果表明自动化文库与手动文库基因覆盖度基本一致,自动化文库制备在减少人力的同时,可保持手动建库的数据质量。

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3)不同样本类型的自动化文库与手动文库测序数据一致性高

通过对人总RNA的自动化文库与手动文库测序结果进行FPKM分析,结果表明自动化建库与手动建库有较强的一致性。

测评结论

基于SP-960高通量样本制备系统与天根生化TIANSeq通用型DNA/RNA 文库构建试剂盒(Cat#NG111/Cat#NR122)的适配应用,可在显著节约时间与人力成本的同时,提供稳定可靠的建库体验。

华大智造MGISP系列自动化建库设备具有可开放性与可拓展性,能够适配多种第三方试剂,为大规模科研检测提供高效稳定的自动化建库解决方案。华大智造实验室智能自动化业务(Generative Lab Intelligence,GLI)对公司原有的"实验室自动化业务"进行了智能技术升级,以先进的"实验室智能自动化"工具和平台为GBI(Generative Bio Intelligence)提供基础支撑,将生命科学实验室所需的软硬件系统、仪器设备和试剂耗材进行“标准化定义”,形成涵盖AI 智能化工具模块、通用自动化设备模块、数据计算存储模块以及生态硬件模块等功能模块库,并搭配设备耗材库,提供AI助力的“Design-Build-Test-Learn”全流程闭环解决方案及丰富参考方案库,已在多组学前沿、分子育种、抗体筛选、生物制药等多领域赋能超50家行业用户,推动实验室从“人工经验”迈向“数据驱动”决策模式,提升整体运行效率与智能化水平。

天根生化适配MGISP-960高通量样本制备系统的产品清单

关于天根生化

天根生化科技(北京)有限公司(简称“天根生化”)不断致力于样本前处理、核酸纯化及下游检测整体解决方案的优化与升级。凭借丰富的专业经验为分子诊断,生物医药,科技服务和畜牧养殖,食品生产加工等领域的企业客户提供从样本处理到核酸提取、检测的定制化解决方案。在高通量测序领域,天根生化也将持续加大研发投入,不断推出更多符合市场需求的高品质产品,为生命科学研究和临床诊断检测贡献力量。

(华大智造)

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