是他，就是他！兰卫医学交付首批Visium HD高分辨率空间转录组实验结果

是他，就是他！

兰卫医学交付首批Visium HD高分辨率空间转录组实验结果

上期回顾：技术前沿丨Visium HD这么热的技术，你！还不赶紧来了解？

文接前序推文提到兰卫医学在国内率先开展Visium HD检测， 已签订逾百例检测，并完成首批检测数据交付。经客户授权，兰卫医学在此分享一例FFPE样本的实测数据，一睹Visium HD高分辨率空间转录组的领先与独到之处。

Visium HD空间转录组项目Space Ranger概述

本批次共上机检测了十余例妇科肿瘤FFPE样本，接下来我们将为各位展示其中一例样本的实测结果，从Space Ranger的结果来看，其检测数据相当稳定和优异。

Space Ranger结果如图所示：

综上：该样本共获得689,387个Bin squares，每个Bin square平均鉴定到的Reads数为1,247.7，平均UMI数为337.0，鉴定到的总基因数为18,032（10x Genomics设计的人探针总基因数为18,085），这也凸显了Visium HD芯片检测全转录表达的能力。

另外，从UMI的热图可以看到Visium HD基于2μm x 2μm的探针检测方案实现了对于全组织覆盖的检测，这比常规的Visium CytAssist芯片的检测效果有着巨大的提升。Visium HD芯片的检测结果真正实现了对于全组织的空间原位全转录组精细图谱的构建，为研究微小组织结构提供了一个强有力的工具。

下图展示了该检测样本的H&E图及组织总UMI数与图像对齐结果，可以看出大部分区域的UMI数都在500，甚至700以上。

而基于Space Ranger的降维聚类后，在8μm Bin Squares下，可以聚成12个clusters。其结果如下图所示：

同时，我们看到在16μm Bin Sequares下，聚成12个clusters。其结果如下图所示：

最后，我们比较了Visium HD芯片在8μm Bin Sequares和16μm Bin Sequares下的检测结果，如下图所示。

以上便是由兰卫医学为您分享的最新Visium HD芯片的实测结果。关注兰卫医学，了解更多Visium HD空间转录组最新进展。同时，欢迎广大科研工作者咨询，先人一步体验Visium HD芯片的全组织单细胞分辨率空间原位检测极致魅力。

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Q&A

1. Visium HD 芯片目前适合哪些样本类型？

    目前10x Genomics公司官方推出的Visium HD芯片可针对人和小鼠的FFPE样本进行检测。

2. Visium HD芯片与目前普通的Visium CytAssist有哪些性能提升？

首先，Visium HD芯片针对捕获区域设计了近1100万个探针组成了连续、没有间隙的密集阵列，增强了探针密度，实现了全组织覆盖；然后，根据10x 官方推荐，在8μm Bin分辨率下可以实现单细胞分辨率的检测.

3. 如何详细了解兰卫医学的Visium HD信息，以及开展Visium HD研究？

可以联系兰卫驻地的前端销售和BD，或关注兰卫公众号，联系我们的客服。我们将会有专业的同事与您取得联系，并与您详细沟通技术细节和项目合作内容。

本文由 市场营销中心 罗克灿 提供

(兰卫医学)